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bioconductor
Bioconductor 为高通量基因组数据的分析和可视化提供开源工具。Bioconductor多数软件包采用R统计编程语言开发。Bioconductor 每年释出两个版本,并有活跃的用户社区。
使用方法:
Bioconductor 镜像源配置文件之一是 ~/.Rprofile
。
注:R 的 ~
在类 Unix 系统下为: $HOME
(即 ~
),在 Windows 下为: %USERPROFILE%\Documents
,具体路径可以在 R 中执行 path.expand("~")
查看。
在该文件末尾添加如下语句或在R/RStudio终端下键入:
options(BioC_mirror="https://mirror.sjtu.edu.cn/bioconductor")
即可使用该 Bioconductor 镜像源安装 Bioconductor 软件包。 命令如下:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("$package_name")
请访问官方网站获取更多信息。
SJTUG Siyuan Mirror
由 上海交通大学 Linux 用户组 (SJTUG) 维护
沪交 ICP 备 20180085